無料版を使用し始めました。レポート>取引合計およびコンバージョン率を含む取引ステージファネルについて質問です。

ファネルレポートとのことなので、ステージを順番に移動した場合にしか数が反映されない設定でレポートを作成された可能性があります。(自分のダッシュボードには同じ名前のレポートがないので、おそらくカスタムレポートのお話かと思います。)

私も以前トライアルでカスタムレポートを作った際に知った設定なのですが、こちらで内容を見ることができます:ファネル(旧)レポートタイプ

ご参考になれば^^