回答します！
・これを新しいテーマに反映させることは出来るか
各ページ（LP、ウェブサイト、ブログ）の設定内で適用するテンプレート（テーマ）を選択できるので、ここでテンプレートを変更するという手法ができます。
しかし、固定モジュール系は引き継ぎできないので、変更元と変更先のテンプレの構成に依存します。ページ自体を複製して、一か八かでお試しください😅
・テーマによって出来ることの違いはあるか
違いあります。開発者が当然違いますので、彼らが考える「使い勝手の良いモジュール」「ページ」が用意されています。また、ソースコードの記述スタイルにによって速度差もあるかもしれません。テーマ、ページ、モジュールの構成までは実際にインストールしないと確認できないのが時間かかります。
個人的なおすすめはSprocket Freeです（アップデートが多いため改善スピードが早い）
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