Hola @JMARTINHERRER1 
La única forma que tiene el CRM de HubSpot para diferenciar empresas e impedir que se dupliquen en el momento de crearlas es mediante la propiedad “Nombre de dominio de la empresa”. Si intentas crear una empresa con un nombre de dominio ya registrado anteriormente te va a avisar, de forma similar a cuando intentas registrar un contacto con un email ya usado previamente.
Creo que no hay forma de usar otro campo indicando que no pueda tener repeticiones, tal y como propones.
Saludos,